では内容が酷い作品を見た時でもお気に入りに追加してから低評価を押すことになるのですがいいのですか？

お気に入り機能を勘違いしてますね
気に入ってなければお気に入り登録しないなんて人ばかりではありません
そんな事をしてしまってはチェックしてる作品が多すぎて見るのが面倒になります
「好きだけど読み終えたから外す」
「気に入ったけどブックマークしてまでまた見たいとは思わない」
これはよくあることです

お気に入りの作品だからお気に入り登録をするのではなく
お気に入り登録はあくまでしおりなのです

ですからそれは何の問題もありません

ログインしていない方が評価を入れてるのでは？

別に問題ないと思いますが。
なんでそれがダメなのかわかりません。